RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeastyeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL017WYLL017W PIK1P39104 1066 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL017WYLL017W CIT3P43635 486 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL017WYLL017W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W PRO1P32264 428 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W PPH3P32345 308 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W TAT1P38085 619 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W CCZ1P38273 704 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YHL012WP38709 493 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W AKR1P39010 764 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data6.71□□□□□ -1.34not detected
YLL017WYLL017W YLL058WQ12198 575 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YVC1Q12324 675 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W ADE8P04161 214 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W SAM35P14693 329 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W DOM34P33309 386 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W MDL2P33311 773 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W PET10P36139 283 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W UGA2P38067 497 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W SAF1P38352 637 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W UBP6P43593 499 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W TOM70P07213 617 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W TOP3P13099 656 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W SKN7P38889 622 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W GDH3P39708 457 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YFL054CP43549 646 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W UGO1Q03327 502 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W LCD1Q04377 747 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W HRQ1Q05549 1077 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W MSD1P15179 658 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YKL151CP36059 337 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YBR284WP38150 797 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W SAH1P39954 449 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W MAL11P53048 616 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YGL081WP53156 320 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W ATG13Q06628 738 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YGR161W-CQ3E744 92 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W AFR1P33304 620 aa6.67□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YRO2P38079 344 aa6.67□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W RCM1P53972 490 aa6.67□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W NTG2Q08214 380 aa6.67□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W BI4P03879 638 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W COQ2P32378 372 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W ICP55P40051 511 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W RRT14P40470 206 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YJR142WP47173 342 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YPR071WQ12346 211 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W YPL034WQ03083 165 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W RSC58Q07979 502 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W MDM38Q08179 573 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL017WYLL017W CHS2P14180 963 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W PEX7P39108 375 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W ALG2P43636 503 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W GYP7P48365 746 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W MTC3P53077 123 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W TRE1Q08919 783 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W MDM12Q92328 271 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W NPP1P25353 742 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W REC104P33323 182 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W PEX6P33760 1030 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W TOK1P40310 691 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W MTC5Q03897 1148 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W IOC4Q04213 475 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W RSB1Q08417 382 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W YLR122CQ12312 125 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W NSI1Q12457 570 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W ACE2P21192 770 aa6.62□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W GIC1P38785 314 aa6.62□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W SRT1Q03175 343 aa6.62□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W MCA1Q08601 432 aa6.62□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W FUN30P31380 1131 aa6.61□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W KAE1P36132 386 aa6.61□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W YER158CP40095 573 aa6.61□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W DNM1P54861 757 aa6.61□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W SRM1P21827 482 aa6.6□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W RAD53P22216 821 aa6.6□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W GSY1P23337 708 aa6.6□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W ERT1P38140 529 aa6.6□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W YKE2P52553 114 aa6.6□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W CDC48P25694 835 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W RPC82P32349 654 aa6.59□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W SFP1P32432 683 aa6.59□□□□□ -1.35
YLL017WYLL017W TFB2Q02939 513 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms