RNA–Protein interactions for RNA: YJL175W

YJL175W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YJL175W, Length 513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL175W	YJL175W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	MCM7	P38132	845 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	ATG14	P38270	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	HSE1	P38753	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	HNT2	P49775	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	SPO20	Q04359	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	SPO21	Q12411	609 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJL175W	YJL175W	DRS2	P39524	1355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	SNF5	P18480	905 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MBP1	P39678	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MXR1	P40029	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MMM1	P41800	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	RKM4	Q12504	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	SPO14	P36126	1683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	TRP3	P00937	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	COQ2	P32378	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YSC84	P32793	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YBR184W	P38299	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PNT1	P38969	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PEX7	P39108	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PFD1	P46988	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	SHE9	Q04172	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	GNT1	Q12096	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	RAD4	P14736	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YKL107W	P34251	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	BAP2	P38084	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	CIT3	P43635	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	RCM1	P53972	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	BDF2	Q07442	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	CHS2	P14180	963 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	KAE1	P36132	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YKR073C	P36153	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	HUL5	P53119	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YGR130C	P53278	816 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	NSE3	Q05541	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YJL175W	YJL175W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	FMP25	Q08023	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	SLA2	P33338	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YKL151C	P36059	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	YJL049W	P47048	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	TNA1	P53322	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	PPM2	Q08282	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MLP2	P40457	1679 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YJL175W	YJL175W	MRP8	P35719	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	YHL012W	P38709	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	IRR1	P40541	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	TRE1	Q08919	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	NUP170	P38181	1502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	CYC7	P00045	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	PBY1	P38254	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	BUD6	P41697	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	CTH1	P47976	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	SDH1	Q00711	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	SSY1	Q03770	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	PDR10	P51533	1564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YJL175W	YJL175W	PIK1	P39104	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	TIM54	P47045	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	MTC3	P53077	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	PRO1	P32264	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	MDL2	P33311	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	UGA2	P38067	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	TOS1	P38288	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL175W	YJL175W	PTC7	P38797	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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