RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A BI4P03879 638 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A ACE2P21192 770 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A SCT1P32784 759 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A TSA1P34760 196 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A PBY1P38254 753 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A YJL049WP47048 450 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A MRPL22P53881 309 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A SIZ1Q04195 904 aa3.59□□□□□ -1.83
RPC10YHR143W-A ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A MBP1P39678 833 aa3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A IRR1P40541 1150 aa3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A TPO2P53283 614 aa3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SGD1Q06132 899 aa3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A PRP9P19736 530 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A APL1P27351 700 aa3.57□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
RPC10YHR143W-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
RPC10YHR143W-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A HRQ1Q05549 1077 aa3.57□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A MDM38Q08179 573 aa3.57□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SOD2P00447 233 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A CMP2P14747 604 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A PRP6P19735 899 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A RNQ1P25367 405 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A GRX1P25373 110 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A HFM1P51979 1187 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A RIM8P53179 542 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A MSC2Q03455 724 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A OSW2Q12202 724 aa3.56□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A GAL10P04397 699 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A FUN30P31380 1131 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A RPC82P32349 654 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A AIM3P38266 947 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A LAM1P38851 1228 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A MTC3P53077 123 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YDR132CQ03900 495 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YDR306CQ06640 478 aa3.55□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A RPS13P05756 151 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A STE5P32917 917 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YKL151CP36059 337 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YKR078WP36158 585 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YBR184WP38299 523 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A GIC1P38785 314 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A TAT2P38967 592 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A UBP5P39944 805 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A PFD1P46988 109 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A NNF1P47149 201 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SRT1Q03175 343 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A GCN5Q03330 439 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SPO75Q07798 868 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A FMP25Q08023 583 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YPL277CQ08989 487 aa3.54□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SRM1P21827 482 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A PPH3P32345 308 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A YAP1801P38856 637 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A MEF2P39677 819 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A SIT1P39980 628 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A GYP7P48365 746 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A ERP6P53198 216 aa3.53□□□□□ -1.84
RPC10YHR143W-A VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data3.53□□□□□ -1.84not detected
RPC10YHR143W-A RAD4P14736 754 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A DOM34P33309 386 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A YER158CP40095 573 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A MND2P40577 368 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A SPT20P50875 604 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ROT1Q03691 256 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A RXT3Q07458 294 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A XYL2Q07993 356 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A OSH2Q12451 1283 aa3.52□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ADE8P04161 214 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A CDC11P32458 415 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A HBS1P32769 611 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A TOD6P34219 525 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A THI80P35202 319 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A YBR238CP38330 731 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A CCC2P38995 1004 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ZRG8P40021 1076 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ALR2P43553 858 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A TIM54P47045 478 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A PLB2Q03674 706 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A DUS4Q06063 367 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A EAF1Q06337 982 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A GPB1Q08886 897 aa3.51□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A HSF1P10961 833 aa3.5□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ENA1P13587 1091 aa3.5□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A ARE1P25628 610 aa3.5□□□□□ -1.85
RPC10YHR143W-A CDC48P25694 835 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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