RNA–Protein interactions for RNA: YHR015W

MIP6, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene MIP6, Length 1,980 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIP6	YHR015W	SPC105	P53148	917 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	UBX4	P54730	416 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	MET14	Q02196	202 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RSC2	Q06488	889 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GSY1	P23337	708 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	SPC29	P33419	253 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	MTC2	P34246	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GYP8	P43570	497 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	SPO74	P45819	413 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	HNT2	P49775	206 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	SOG2	Q08817	791 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
MIP6	YHR015W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	SIT1	P39980	628 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YIG1	Q08956	461 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GNT1	Q12096	491 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YER152C	P10356	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	NPP1	P25353	742 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	EXO84	P38261	753 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RGD1	P38339	666 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	PNT1	P38969	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	TOK1	P40310	691 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	NIT2	P47016	307 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RKM2	Q03942	479 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	PTC5	Q12511	572 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	DPB3	P27344	201 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	PPH3	P32345	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YRO2	P38079	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	AIM14	P53109	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	MXR1	P40029	184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	PRK1	P40494	810 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	NEO1	P40527	1151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	LSC2	P53312	427 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	LCD1	Q04377	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	ENT2	Q05785	613 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RSC3	Q06639	885 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	NIC96	P34077	839 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YKL151C	P36059	337 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	KTR4	P38131	464 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	CKB2	P38930	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	CAF16	P43569	289 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	HMG1	P12683	1054 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	RPN12	P32496	274 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YEL1	P34225	687 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	MCD4	P36051	919 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	HEH2	Q03281	663 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	GUD1	Q07729	489 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIP6	YHR015W	AEP2	P22136	580 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	PTP2	P29461	750 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	MEC3	Q02574	474 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	ATG33	Q06485	197 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	MIH1	P23748	554 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	KCC4	P25389	1037 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	PER1	P25625	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	YHL041W	P38730	149 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	ACO2	P39533	789 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	YFL054C	P43549	646 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	CAF120	P53836	1060 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MIP6	YHR015W	ADE8	P04161	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms