RNA–Protein interactions for RNA: YER063W

THO1, Transcript of Conserved nuclear RNA-binding protein, yeast

Gene THO1, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THO1	YER063W	CDA2	Q06703	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	ACE2	P21192	770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	APL1	P27351	700 aa		4.72	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	RRT14	P40470	206 aa		4.72	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
THO1	YER063W	MRP8	P35719	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SGD1	Q06132	899 aa		4.71	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	UBP5	P39944	805 aa		4.7	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	CMP2	P14747	604 aa		4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	LAM1	P38851	1228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	HFM1	P51979	1187 aa		4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	GAL10	P04397	699 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	YKL151C	P36059	337 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	PBY1	P38254	753 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	IRR1	P40541	1150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	MTC3	P53077	123 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	RIM8	P53179	542 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	ROT1	Q03691	256 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
THO1	YER063W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.68	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SOD2	P00447	233 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SRM1	P21827	482 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	MEF2	P39677	819 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	MSC2	Q03455	724 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	PLB2	Q03674	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	MDM38	Q08179	573 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	OSW2	Q12202	724 aa		4.67	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	STE5	P32917	917 aa		4.66	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	THI80	P35202	319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	YBR184W	P38299	523 aa		4.66	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.66	□□□□□ -1.66
THO1	YER063W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	TOD6	P34219	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
THO1	YER063W	SPT20	P50875	604 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GCN5	Q03330	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	XYL2	Q07993	356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	FUN30	P31380	1131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	PPH3	P32345	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GIC1	P38785	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YAP1801	P38856	637 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	SRT1	Q03175	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	TPO2	P53283	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	DUS4	Q06063	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	SPO75	Q07798	868 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ADE8	P04161	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ENA1	P13587	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	TAT2	P38967	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	PFD1	P46988	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	RXT3	Q07458	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	FMP25	Q08023	583 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GPB1	Q08886	897 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YLR358C	O13565	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	RAD4	P14736	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	NPP2	P39997	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	MND2	P40577	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ALR2	P43553	858 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YJL049W	P47048	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GYP7	P48365	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	CDC6	P09119	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
THO1	YER063W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	DOM34	P33309	386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YRO2	P38079	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	POA1	P38218	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	TIM54	P47045	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	GCV2	P49095	1034 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	SFB2	P53953	876 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	EAF1	Q06337	982 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THO1	YER063W	ESC8	Q08119	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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