RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	ADP1	P25371	1049 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	ELM1	P32801	640 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	ATG14	P38270	344 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	PEX7	P39108	375 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	YGL140C	P53120	1219 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	SSY1	Q03770	852 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	AOS1	Q06624	347 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	DFG16	Q99234	619 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CPR4	YCR069W	SNF2	P22082	1703 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	HSP78	P33416	811 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	SLD2	P34252	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	HSE1	P38753	452 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YNR063W	P53749	607 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	LAP2	Q10740	671 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	SLM3	Q12093	417 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RSF2	P46974	1380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	PRO1	P32264	428 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	SEG2	P34250	1132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RDH54	P38086	958 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	ECL1	P48235	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	AUS1	Q08409	1394 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	FKS3	Q04952	1785 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	CDC45	Q08032	650 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	SIR4	P11978	1358 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	ADD66	P36040	267 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	PTC7	P38797	343 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	PIC2	P40035	300 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RKM2	Q03942	479 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RNQ1	P25367	405 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	GTS1	P40956	396 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YGR122W	P53272	402 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	ORC3	P54790	616 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YHL012W	P38709	493 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YML020W	Q03722	664 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	EST2	Q06163	884 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	HIM1	Q06674	414 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	ENT1	Q12518	454 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CPR4	YCR069W	YRF1-4	O13559	1382 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	PRD1	P25375	712 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	YJL045W	P47052	634 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MCD1	Q12158	566 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	SAM35	P14693	329 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MAM1	P40065	302 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	NIT1	P40447	199 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MRPS18	P42847	217 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	VPS53	P47061	822 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	POL32	P47110	350 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	DSD1	P53095	428 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	YNL050C	P53952	270 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	YDL144C	Q07589	356 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	LYS2	P07702	1392 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	AFG2	P32794	780 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MGE1	P38523	228 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	YIL177C	P40434	1758 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	YJL225C	P40889	1758 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	RAD2	P07276	1031 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	CYC8	P14922	966 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	ATE1	P16639	503 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MDL2	P33311	773 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	TAF13	P11747	167 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MCM2	P29469	868 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	UBP5	P39944	805 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.67	□□□□□ -1.5	not detected
CPR4	YCR069W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	HDA2	Q06629	674 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	YSC84	P32793	468 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	MDG1	P53885	366 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
CPR4	YCR069W	NSE3	Q05541	303 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	CDA2	Q06703	312 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	PTC5	Q12511	572 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CPR4	YCR069W	KCC4	P25389	1037 aa		5.65	□□□□□ -1.5

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