RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	EPS15	P42566	896 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	FOXO3	O43524	673 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCA8	O94911	1581 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	GJB2	P29033	226 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	INSR	P06213	1382 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	WASF1	Q92558	559 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	VAMP4	O75379	141 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SNX21	Q969T3	373 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	AK7	Q96M32	723 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SYNM	O15061	1565 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023		A0A087WZG4	1122 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PDE1A	P54750	535 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	STX6	O43752	255 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	MSH6	P52701	1360 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.34	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.33	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.33	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	FLT4	P35916	1363 aa		13.33	□□□□□ -0.27
AKAP9-216	ENST00000619023	TRPM2	O94759	1503 aa		13.33	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.33	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SEC24B	O95487	1268 aa		13.33	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.33	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ANXA1	P04083	346 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLIM4	O00461	696 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF213	O14771	459 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	STIM1	Q13586	685 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC5A1	P13866	664 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28

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