RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 NUCB1Q02818 461 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC22Q5TAA0 569 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYM3Q14202 1370 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC39A6Q13433 755 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 EVI5LQ96CN4 794 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPYL6Q8N831 410 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SOGA3Q5TF21 947 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 NAPBQ9H115 298 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 FLT4P35916 1363 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNA6P17658 529 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 RLBP1P12271 317 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K12Q12852 859 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 VAMP4O75379 141 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINC1P01008 464 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 MSH6P52701 1360 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT24Q2M2I5 525 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRL2O95490 1459 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SNRKQ9NRH2 765 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLIM4O00461 696 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SSFA2P28290 1259 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 COPS6Q7L5N1 327 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 EYA1Q99502 592 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC1P33527 1531 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 SYCE3A1L190 88 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC5A1P13866 664 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 WASF1Q92558 559 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 SDSP20132 328 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF213O14771 459 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 IL27Q8NEV9 243 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 TBX22Q9Y458 520 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 GCP02774 474 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE1AP54750 535 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K11Q16584 847 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 USP5P45974 858 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCE1Q969G3 411 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 KSR2Q6VAB6 950 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 DACH1Q9UI36 760 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCY1B3Q02153 619 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 GRM8O00222 908 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP8B2P98198 1209 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CAMK4Q16566 473 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 C8orf76Q96K31 380 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFYVE9O95405 1425 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDH1L1O75891 902 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 STIM1Q13586 685 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 PBRM1Q86U86 1689 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP7AQ04656 1500 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms