RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.38■■□□□ 1.49
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PTPRJ-208ENST00000615445 TTC22Q5TAA0 569 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYM3Q14202 1370 aa24.38■■□□□ 1.49
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PTPRJ-208ENST00000615445 EVI5LQ96CN4 794 aa24.37■■□□□ 1.49
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PTPRJ-208ENST00000615445 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.3■■□□□ 1.48
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PTPRJ-208ENST00000615445 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRJ-208ENST00000615445 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-208ENST00000615445 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.24■■□□□ 1.47
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