RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IFT57	Q9NWB7	429 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	IL16	Q14005	1332 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	CHL1	O00533	1208 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FCHO1-215	ENST00000596522	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	WWC1	Q8IX03	1113 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	C4A	P0C0L4	1744 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	RPS6KA4	O75676	772 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	WDR63	Q8IWG1	891 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	KCNQ3	O43525	872 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	HOXB7	P09629	217 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	POLD1	P28340	1107 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MSL1	Q68DK7	614 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF853	P0CG23	659 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ARX	Q96QS3	562 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ERBB4	Q15303	1308 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A087WZG4	1122 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-215	ENST00000596522	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	MBIP	Q9NS73	344 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	RFC4	P35249	363 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	COL15A1	P39059	1388 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	SYT17	Q9BSW7	474 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	USP16	Q9Y5T5	823 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF521	Q96K83	1311 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	RGL2	O15211	777 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	ZPR1	O75312	459 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-215	ENST00000596522	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	GOLGA2	Q08379	1002 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	NARF	Q9UHQ1	456 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522		E9PSI1	815 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	A1BG	P04217	495 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	GYS1	P13807	737 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	MMP10	P09238	476 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	FKBP8	Q14318	412 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	NBPF26	B4DH59	902 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	NBPF15	Q8N660	670 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-215	ENST00000596522	KRT24	Q2M2I5	525 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	HYPK	Q9NX55	129 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	SCN7A	Q01118	1682 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	STK31	Q9BXU1	1019 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-215	ENST00000596522	CAMTA2	O94983	1202 aa		18.24	■□□□□ 0.51

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