RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592175.5

KDM4B-210, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 4

Gene KDM4B, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-210ENST00000592175 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
KDM4B-210ENST00000592175 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.58■■□□□ 1.05
KDM4B-210ENST00000592175 COL15A1P39059 1388 aa21.58■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 GRIN3BO60391 1043 aa21.57■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 DCTN1Q14203 1278 aa21.57■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 A0A087WZG4 1122 aa21.56■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 15.7
KDM4B-210ENST00000592175 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 NARFQ9UHQ1 456 aa21.56■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 UTRNP46939 3433 aa21.55■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 KCNQ3O43525 872 aa21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 TGFB2P61812 414 aa21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 FKBP8Q14318 412 aa21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.53■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.52■■□□□ 1.04
KDM4B-210ENST00000592175 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 TM4SF1P30408 202 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 RIPK4P57078 832 aa21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.5■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.031e-10■□□□□ 9.4
KDM4B-210ENST00000592175 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 RUNDC1Q96C34 613 aa21.49■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 USP16Q9Y5T5 823 aa21.49■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 CHD4Q14839 1912 aa21.49■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 A1BGP04217 495 aa21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 DDR1Q08345 913 aa21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.48■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.47■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 NFIXQ14938 502 aa21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
KDM4B-210ENST00000592175 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.44■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.43■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.43■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 RGL2O15211 777 aa21.43■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.43■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 A0A0G2JLW4 131 aa21.42■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.42■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 CAMTA2O94983 1202 aa21.41■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 SERPINB2P05120 415 aa21.41■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 DPEP1P16444 411 aa21.41■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.41■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.41■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 SCN7AQ01118 1682 aa21.4■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 NEUROD2Q15784 382 aa21.4■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.39■■□□□ 1.02
KDM4B-210ENST00000592175 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.39■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.39■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 PIM2Q9P1W9 311 aa21.39■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 ERBB4Q15303 1308 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 NBPF26B4DH59 902 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 ANP32CO43423 234 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 NBPF15Q8N660 670 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 SETDB2Q96T68 719 aa21.38■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 KCNA3P22001 575 aa21.37■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.37■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 BCS1LQ9Y276 419 aa21.37■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.36■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.36■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 CHL1O00533 1208 aa21.35■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 BCORQ6W2J9 1755 aa21.34■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 CNBD1Q8NA66 436 aa21.33■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.33■■□□□ 1.01
KDM4B-210ENST00000592175 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.32■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 APAF1O14727 1248 aa21.32■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 NPHP1O15259 732 aa21.32■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 CHRNA5P30532 468 aa21.32■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 PDE6BP35913 854 aa21.32■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 H0YIN7 160 aa21.31■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 ST5P78524 1137 aa21.31■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.31■■□□□ 1
KDM4B-210ENST00000592175 CFAP44Q96MT7 982 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms