RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TMX1Q9H3N1 280 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 MED4Q9NPJ6 270 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TOMM22Q9NS69 142 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PHLPP1O60346 1717 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TPM4P67936 248 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 CABP2Q9NPB3 220 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PTCH1Q13635 1447 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE3AQ14432 1141 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF11Q86T75 865 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC36A6NLP5 189 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SMTNL1A8MU46 457 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHDP01880 384 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SSFA2P28290 1259 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF20Q5VTR2 975 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RABEP1Q15276 862 aa9.27□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMD1Q99460 953 aa9.27□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 RAD50Q92878 1312 aa9.27□□□□□ -0.92
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP6V1AP38606 617 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 DRC1Q96MC2 740 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PIK3C2GO75747 1445 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 MYO1CO00159 1063 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CDK19Q9BWU1 502 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 EVC2Q86UK5 1308 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF3CO14782 793 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 MTHFSP49914 203 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 TRDNQ13061 729 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF214Q8ND24 703 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SUFUQ9UMX1 484 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP6O75581 1613 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SYCE3A1L190 88 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 LIG1P18858 919 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 RPAINQ86UA6 219 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 STRN4Q9NRL3 753 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 BCAR3O75815 825 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP2B1P20020 1258 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF4Q96M43 638 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 TNNT1P13805 278 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SEMA3FQ13275 785 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF217Q8TC41 542 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 AK7Q96M32 723 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP2K2P36507 400 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 EVA1CP58658 441 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 SLFN5Q08AF3 891 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 ABTB2Q8N961 1025 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 CHRNA2Q15822 529 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 COG6Q9Y2V7 657 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-218ENST00000590367 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms