RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 FKBP8Q14318 412 aa16.1■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 NFE2L2Q16236 605 aa16.1■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 NARFQ9UHQ1 456 aa16.1■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 A0A087WZG4 1122 aa16.09■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
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SNHG25-201ENST00000580828 TGFB2P61812 414 aa16.09■□□□□ 0.17
SNHG25-201ENST00000580828 DCTN1Q14203 1278 aa16.09■□□□□ 0.17
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SNHG25-201ENST00000580828 KCNQ3O43525 872 aa16.08■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 TM4SF1P30408 202 aa16.08■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.08■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 COL15A1P39059 1388 aa16.08■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 C4AP0C0L4 1744 aa16.07■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 CHD4Q14839 1912 aa16.06■□□□□ 0.16
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SNHG25-201ENST00000580828 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 DDR1Q08345 913 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 A1BGP04217 495 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 USP16Q9Y5T5 823 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 NFIXQ14938 502 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 A0A0G2JLW4 131 aa16.02■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 RIPK4P57078 832 aa16.02■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.02■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.02■□□□□ 0.16
SNHG25-201ENST00000580828 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.02■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 DPEP1P16444 411 aa16.01■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.01■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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SNHG25-201ENST00000580828 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 SERPINB2P05120 415 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 RUNDC1Q96C34 613 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 PIM2Q9P1W9 311 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.99■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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SNHG25-201ENST00000580828 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
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SNHG25-201ENST00000580828 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.97■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.97■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 NBPF26B4DH59 902 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 NBPF15Q8N660 670 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 SETDB2Q96T68 719 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.96■□□□□ 0.15
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.95■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.95■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 CHRNA5P30532 468 aa15.94■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.94■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 NEUROD2Q15784 382 aa15.93■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.93■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.93■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.93■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.92■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 H0YIN7 160 aa15.92■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.92■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 SCN7AQ01118 1682 aa15.92■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 ERBB4Q15303 1308 aa15.92■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 CHL1O00533 1208 aa15.91■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 PDE6BP35913 854 aa15.91■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.91■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.91■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 CNBD1Q8NA66 436 aa15.91■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.9■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 NPHP1O15259 732 aa15.9■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 TTLL6Q8N841 843 aa15.9■□□□□ 0.14
SNHG25-201ENST00000580828 ADCY9O60503 1353 aa15.89■□□□□ 0.13
SNHG25-201ENST00000580828 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SNHG25-201ENST00000580828 ST5P78524 1137 aa15.89■□□□□ 0.13
SNHG25-201ENST00000580828 ATP10DQ9P241 1426 aa15.88■□□□□ 0.13
SNHG25-201ENST00000580828 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.88■□□□□ 0.13
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