RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 USP16Q9Y5T5 823 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 SIK1P57059 783 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-210ENST00000568388 BCAR3O75815 825 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 ERBB4Q15303 1308 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 PLSCR1O15162 318 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 STK31Q9BXU1 1019 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 ATP6V1AP38606 617 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 STARD3NLO95772 234 aa23.98■■□□□ 1.43
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SPNS1-210ENST00000568388 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 ITPK1Q13572 414 aa23.96■■□□□ 1.43
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SPNS1-210ENST00000568388 NECTIN2Q92692 538 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-210ENST00000568388 KIF16BQ96L93 1317 aa23.95■■□□□ 1.42
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SPNS1-210ENST00000568388 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.95■■□□□ 1.42
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SPNS1-210ENST00000568388 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 HYPKQ9NX55 129 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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SPNS1-210ENST00000568388 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 A1BGP04217 495 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRCP08575 1304 aa23.91■■□□□ 1.42
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SPNS1-210ENST00000568388 NBPF15Q8N660 670 aa23.91■■□□□ 1.42
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SPNS1-210ENST00000568388 PROSER3Q2NL68 480 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 G2E3Q7L622 706 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS1-210ENST00000568388 TXNRD1Q16881 649 aa23.89■■□□□ 1.41
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SPNS1-210ENST00000568388 PLIN1O60240 522 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 MS4A1P11836 297 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 MYL6BP14649 208 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 KCNQ4P56696 695 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 PDE3AQ14432 1141 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 C4BP0C0L5 1744 aa23.86■■□□□ 1.41
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SPNS1-210ENST00000568388 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
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SPNS1-210ENST00000568388 COPS6Q7L5N1 327 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-210ENST00000568388 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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SPNS1-210ENST00000568388 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 CASZ1Q86V15 1759 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 RPS6KA4O75676 772 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 KSR2Q6VAB6 950 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC4O15439 1325 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 TNNQ9UQP3 1299 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 ADCY9O60503 1353 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 A0A087WZG4 1122 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-210ENST00000568388 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.77■■□□□ 1.4
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