RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PUF60-222	ENST00000533362	MSH5	O43196	834 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PUF60-222	ENST00000533362	WDR63	Q8IWG1	891 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PUF60-222	ENST00000533362	PHF14	O94880	888 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF853	P0CG23	659 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	MBIP	Q9NS73	344 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	HOXB7	P09629	217 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	RFC4	P35249	363 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PUF60-222	ENST00000533362		A0A087WZG4	1122 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	LRP5	O75197	1615 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	COL15A1	P39059	1388 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	A1BG	P04217	495 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	POLD1	P28340	1107 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF521	Q96K83	1311 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	C4A	P0C0L4	1744 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PUF60-222	ENST00000533362	ZPR1	O75312	459 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	SMIM5	Q71RC9	77 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	GOLGA2	Q08379	1002 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	KRT24	Q2M2I5	525 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PUF60-222	ENST00000533362	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	NBPF26	B4DH59	902 aa		29	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362		E9PSI1	815 aa		29	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	GYS1	P13807	737 aa		29	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	NBPF15	Q8N660	670 aa		29	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	PTGER2	P43116	358 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	ARX	Q96QS3	562 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	RGL2	O15211	777 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.97	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	MYL6B	P14649	208 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.96	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PUF60-222	ENST00000533362	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	PDIA6	Q15084	440 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	MMP10	P09238	476 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	FKBP8	Q14318	412 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	STK31	Q9BXU1	1019 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PUF60-222	ENST00000533362	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PUF60-222	ENST00000533362	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.88	■■■□□ 2.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.7 ms