RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	KCNQ3	O43525	872 aa		28.22	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	STARD3NL	O95772	234 aa		28.22	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.22	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.21	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	GPR162	Q16538	588 aa		28.21	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		28.21	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.2	■■■□□ 2.11
EML3-215	ENST00000526116	YY1	P25490	414 aa		28.19	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.18	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	FKBP8	Q14318	412 aa		28.17	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.17	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	ZPR1	O75312	459 aa		28.16	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.15	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.15	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		28.14	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.14	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
EML3-215	ENST00000526116	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.13	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	TM4SF1	P30408	202 aa		28.12	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	DDR1	Q08345	913 aa		28.12	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.12	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116		A0A087WZG4	1122 aa		28.1	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.1	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.1	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.1	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	A1BG	P04217	495 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	TGFB2	P61812	414 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.09	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
EML3-215	ENST00000526116	RIPK4	P57078	832 aa		28.07	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	NFIX	Q14938	502 aa		28.06	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.06	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.03	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.02	■■■□□ 2.08
EML3-215	ENST00000526116		A0A0G2JLW4	131 aa		28.01	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	DPEP1	P16444	411 aa		28	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		27.99	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	KCNA3	P22001	575 aa		27.98	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.98	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	SERPINB2	P05120	415 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.96	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		27.96	■■■□□ 2.07
EML3-215	ENST00000526116	NEUROD2	Q15784	382 aa		27.95	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	RGL2	O15211	777 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	BCS1L	Q9Y276	419 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	CHRNA5	P30532	468 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	CHL1	O00533	1208 aa		27.89	■■■□□ 2.06
EML3-215	ENST00000526116	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	NUP98	P52948	1817 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	ADCY9	O60503	1353 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	APAF1	O14727	1248 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	ANP32C	O43423	234 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EML3-215	ENST00000526116	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.81	■■■□□ 2.04

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