RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510032.5

FAM200B-215, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 2

Gene FAM200B, Length 639 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-215	ENST00000510032	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		29.45	■■■□□ 2.31
FAM200B-215	ENST00000510032	ARX	Q96QS3	562 aa		29.44	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	MSL1	Q68DK7	614 aa		29.43	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.43	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.42	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29.4	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
FAM200B-215	ENST00000510032	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.37	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032		A0A087WZG4	1122 aa		29.35	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	ZPR1	O75312	459 aa		29.35	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.35	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	COL15A1	P39059	1388 aa		29.35	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		29.34	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.34	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.34	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	A1BG	P04217	495 aa		29.33	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
FAM200B-215	ENST00000510032	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.32	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	CHL1	O00533	1208 aa		29.32	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	GYS1	P13807	737 aa		29.32	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	CFAP44	Q96MT7	982 aa		29.3	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29.3	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	CCDC27	Q2M243	656 aa		29.29	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	KLHL34	Q8N239	644 aa		29.29	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	MMP10	P09238	476 aa		29.28	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	CCER2	I3L3R5	266 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	GNAI1	P63096	354 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	IFT57	Q9NWB7	429 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	C4A	P0C0L4	1744 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FAM200B-215	ENST00000510032	FKBP8	Q14318	412 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.24	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.23	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	NGEF	Q8N5V2	710 aa		29.23	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	WWC1	Q8IX03	1113 aa		29.22	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.22	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF853	P0CG23	659 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	MBIP	Q9NS73	344 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FAM200B-215	ENST00000510032	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.2	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.2	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	HOXB7	P09629	217 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	IL16	Q14005	1332 aa		29.17	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	TM4SF1	P30408	202 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	CAMTA2	O94983	1202 aa		29.15	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	MYL6B	P14649	208 aa		29.14	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	NFIX	Q14938	502 aa		29.14	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	WDR63	Q8IWG1	891 aa		29.14	■■■□□ 2.26
FAM200B-215	ENST00000510032	RGL2	O15211	777 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	DDR1	Q08345	913 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	KRT24	Q2M2I5	525 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		29.12	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	SCN7A	Q01118	1682 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	NECTIN2	Q92692	538 aa		29.1	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	SETDB2	Q96T68	719 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		29.09	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	29.08	■■■□□ 2.25
FAM200B-215	ENST00000510032	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	SERPINB2	P05120	415 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	PDIA6	Q15084	440 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	MIER1	Q8N108	512 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	TGFB2	P61812	414 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM200B-215	ENST00000510032	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms