RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 CEP170Q5SW79 1584 aa16.96■□□□□ 0.31
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PTPRU-204ENST00000428026 PAF1Q8N7H5 531 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRU-204ENST00000428026 TMC6Q7Z403 805 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-204ENST00000428026 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-204ENST00000428026 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-204ENST00000428026 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRU-204ENST00000428026 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.85■□□□□ 0.29
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