RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR63	Q8IWG1	891 aa		12.53	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPATCH11	Q8N954	259 aa		12.53	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		12.53	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		12.52	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST18	O60284	1047 aa		12.52	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		12.52	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP48	Q86UV5	1035 aa		12.52	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		12.52	□□□□□ -0.4
AFG3L1P-208	ENST00000427658	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRMP	Q12912	555 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF592	Q92610	1267 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ELF2	Q15723	593 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP83	Q9Y592	693 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPHP1	O15259	732 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MX1	P20591	662 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP135	Q66GS9	1140 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC172	P0C7W6	258 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RUNDC1	Q96C34	613 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DRC1	Q96MC2	740 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLA2G4A	P47712	749 aa		12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST5	P78524	1137 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSCAN26	Q16670	478 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEX35	Q5T0J7	233 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPRC	P08575	1304 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERO1A	Q96HE7	468 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMX3	Q96JJ7	454 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMARCE1	Q969G3	411 aa		12.46	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.46	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERBB3	P21860	1342 aa		12.46	□□□□□ -0.41
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.46	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRL	Q86TD4	932 aa		12.46	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GCC1	Q96CN9	775 aa		12.46	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK26	Q9P289	416 aa		12.46	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		12.46	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAD50	Q92878	1312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.45	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		12.45	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP32	Q8NFA0	1604 aa		12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1B0GUL7	405 aa		12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DRC7	Q8IY82	874 aa		12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		12.44	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLCN6	P51797	869 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITSN1	Q15811	1721 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP2B1	P20020	1258 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEK4	P51957	841 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.43	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPM4	P67936	248 aa		12.42	□□□□□ -0.42
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		12.42	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms