RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 PLIN1O60240 522 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC4A2P04920 1241 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 PROSER3Q2NL68 480 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 PDIA6Q15084 440 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 A1BGP04217 495 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 G2E3Q7L622 706 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 STK31Q9BXU1 1019 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 NBPF26B4DH59 902 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 APBA3O96018 575 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 NBPF14Q5TI25 921 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 NBPF15Q8N660 670 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
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SH3BP5-203ENST00000408919 TNNQ9UQP3 1299 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 RREB1Q92766 1687 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 STARD3NLO95772 234 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 MYL6BP14649 208 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 PROM2Q8N271 834 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-203ENST00000408919 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF16BQ96L93 1317 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 PLSCR1O15162 318 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 FLIIQ13045 1269 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 ERBB4Q15303 1308 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 TXNRD1Q16881 649 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 TRIM27P14373 513 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 C4BP0C0L5 1744 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 HYPKQ9NX55 129 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 RLBP1P12271 317 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP5-203ENST00000408919 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRCP08575 1304 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 COPS6Q7L5N1 327 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 PANK1Q8TE04 598 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 F6X3S4 739 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 SMIM5Q71RC9 77 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 ADCY9O60503 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
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SH3BP5-203ENST00000408919 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCC4O15439 1325 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 PDE3AQ14432 1141 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP5-203ENST00000408919 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 GNPATO15228 680 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 BAG6P46379 1132 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 ILDR2Q71H61 639 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 KSR2Q6VAB6 950 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 C4AP0C0L4 1744 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-203ENST00000408919 COL15A1P39059 1388 aa22.68■■□□□ 1.22
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