RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 PAFAH1B1P43034 410 aa21.61■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.61■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP3K1Q13233 1512 aa21.61■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 IGSF3O75054 1194 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 GUCY1B3Q02153 619 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 C8orf76Q96K31 380 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 BIN1O00499 593 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 SKILP12757 684 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 LUZP1Q86V48 1076 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 TMX3Q96JJ7 454 aa21.6■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCC11Q96J66 1382 aa21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 SNX21Q969T3 373 aa21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.59■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
AMIGO1-202ENST00000369864 IVLP07476 585 aa21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 ABTB2Q8N961 1025 aa21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 ARHGEF11O15085 1522 aa21.57■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CNNM3Q8NE01 707 aa21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 YEATS4O95619 227 aa21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 TTC22Q5TAA0 569 aa21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.56■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAI1Q9UI46 699 aa21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SOGA3Q5TF21 947 aa21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 USP48Q86UV5 1035 aa21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SPG7Q9UQ90 795 aa21.54■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.54■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC175P0C221 793 aa21.54■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 RAPGEF3O95398 923 aa21.54■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 FEZ1Q99689 392 aa21.54■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 IQGAP2Q13576 1575 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 NUCB1Q02818 461 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SPECC1Q5M775 1068 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 MCM6Q14566 821 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM177BA6PVY3 158 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 TDO2P48775 406 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 DNA2P51530 1060 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.53■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 OGFRQ9NZT2 677 aa21.52■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 MYL6BP14649 208 aa21.52■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 SMC5Q8IY18 1101 aa21.52■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.52■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.52■■□□□ 1.04
AMIGO1-202ENST00000369864 LIG1P18858 919 aa21.52■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.51■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 F6X3S4 739 aa21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 CAPN2P17655 700 aa21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 MCM10Q7L590 875 aa21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AMIGO1-202ENST00000369864 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms