RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 ZSCAN12O43309 604 aa23.73■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 MCM4P33991 863 aa23.73■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 MAP3K12Q12852 859 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 ANO10Q9NW15 660 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 SLC5A1P13866 664 aa23.72■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 NFE2L2Q16236 605 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF213O14771 459 aa23.72■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 GBP3Q9H0R5 595 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.72■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 NCOA2Q15596 1464 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 MYZAPP0CAP1 466 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 IQCA1Q86XH1 822 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 CNNM3Q8NE01 707 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.7■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.7■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.7■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 RAB34Q9BZG1 259 aa23.7■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.389e-8■■■■■ 30.5
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 GPTP24298 496 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 WDR70Q9NW82 654 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 PPFIA3O75145 1194 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 SAMM50Q9Y512 469 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 ERBINQ96RT1 1412 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 BIN1O00499 593 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 CBX1P83916 185 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 MAP9Q49MG5 647 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 FEZ1Q99689 392 aa23.69■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 PANK2Q9BZ23 570 aa23.68■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 C6orf229H3BNL8 230 aa23.68■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 PRC1O43663 620 aa23.68■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 ISM2Q6H9L7 571 aa23.68■■□□□ 1.38
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 F6X3S4 739 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 FCHSD2O94868 740 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 YEATS4O95619 227 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 SPECC1Q5M775 1068 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 ESPNB1AK53 854 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 PAFAH1B1P43034 410 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 IDEP14735 1019 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.65■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.65■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
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ZBED3-201ENST00000255198 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.64■■□□□ 1.38
ZBED3-201ENST00000255198 KIF18AQ8NI77 898 aa23.64■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 FSIP1Q8NA03 581 aa23.64■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.64■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 LMAN1P49257 510 aa23.64■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 CALML4Q96GE6 196 aa23.63■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 A0A087WZG4 1122 aa23.63■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 BICD1Q96G01 975 aa23.63■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.63■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.63■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 TMC6Q7Z403 805 aa23.62■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.62■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.62■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.62■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 RAPGEF3O95398 923 aa23.61■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.61■■□□□ 1.37
ZBED3-201ENST00000255198 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.61■■□□□ 1.37
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