RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 C4AP0C0L4 1744 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 STARD3NLO95772 234 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 GNAI1P63096 354 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 MBIPQ9NS73 344 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 USP16Q9Y5T5 823 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 SSFA2P28290 1259 aa28.36■■■□□ 2.13
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.36■■■□□ 2.13
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SLC25A39-201ENST00000225308 RPS6KA4O75676 772 aa28.35■■■□□ 2.13
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF521Q96K83 1311 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR63Q8IWG1 891 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT24Q2M2I5 525 aa28.32■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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SLC25A39-201ENST00000225308 ADRA2BP18089 450 aa28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB7AO95365 584 aa28.29■■■□□ 2.12
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SLC25A39-201ENST00000225308 MSH5O43196 834 aa28.28■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.28■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.28■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 LRP5O75197 1615 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 COL15A1P39059 1388 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-201ENST00000225308 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
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SLC25A39-201ENST00000225308 MTFR1LQ9H019 292 aa28.26■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF26B4DH59 902 aa28.25■■■□□ 2.11
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SLC25A39-201ENST00000225308 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.24■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXB7P09629 217 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.22■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 RFC4P35249 363 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 SPON1Q9HCB6 807 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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SLC25A39-201ENST00000225308 TSPYL6Q8N831 410 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-201ENST00000225308 BCORQ6W2J9 1755 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-201ENST00000225308 GYS1P13807 737 aa28.18■■■□□ 2.1
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SLC25A39-201ENST00000225308 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-201ENST00000225308 PDIA6Q15084 440 aa28.17■■■□□ 2.1
SLC25A39-201ENST00000225308 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.17■■■□□ 2.1
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SLC25A39-201ENST00000225308 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.15■■■□□ 2.1
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SLC25A39-201ENST00000225308 PROSER3Q2NL68 480 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-201ENST00000225308 ZPR1O75312 459 aa28.14■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.14■■■□□ 2.09
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SLC25A39-201ENST00000225308 E9PSI1 815 aa28.13■■■□□ 2.09
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SLC25A39-201ENST00000225308 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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SLC25A39-201ENST00000225308 FKBP8Q14318 412 aa28.11■■■□□ 2.09
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SLC25A39-201ENST00000225308 ARXQ96QS3 562 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 NUP98P52948 1817 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 CACNA1FO60840 1977 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 POLD1P28340 1107 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SLC25A39-201ENST00000225308 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 MMP10P09238 476 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A39-201ENST00000225308 VAMP4O75379 141 aa28.05■■■□□ 2.08
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.05■■■□□ 2.08
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