RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stk36Q69ZM6 1316 aa28.8■■■□□ 2.2
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp8b2P98199 1209 aa28.79■■■□□ 2.2
Suds3-201ENSMUST00000086471 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc27Q3V036 639 aa28.77■■■□□ 2.2
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cetn4Q8K4K1 168 aa28.77■■■□□ 2.2
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nphp1Q9QY53 687 aa28.77■■■□□ 2.2
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tgfb1i1Q62219 461 aa28.76■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zeb2Q9R0G7 1215 aa28.76■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mmp8O70138 465 aa28.75■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa28.75■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aldh8a1Q8BH00 487 aa28.75■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Syde2E9PUP1 1314 aa28.75■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nkx1-2P42580 305 aa28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sik1Q60670 779 aa28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ier5O89113 308 aa28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 CalcaP70160 136 aa28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Crb1Q8VHS2 1405 aa28.74■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnh4A2A5F7 1018 aa28.73■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa28.73■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atg3Q9CPX6 314 aa28.73■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppm1mQ8BU27 406 aa28.72■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Flad1Q8R123 492 aa28.72■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa28.72■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Jarid2Q62315 1234 aa28.72■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bcar3Q9QZK2 820 aa28.71■■■□□ 2.19
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nek4Q9Z1J2 792 aa28.71■■■□□ 2.19
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Suds3-201ENSMUST00000086471 NmiO35309 314 aa28.69■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gcc1Q9D4H2 778 aa28.68■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 MypnQ5DTJ9 1315 aa28.68■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa28.68■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cgnl1Q6AW69 1298 aa28.68■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Exoc5Q3TPX4 708 aa28.67■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa28.67■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28.67■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 HellsQ60848 821 aa28.66■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Grm8P47743 908 aa28.65■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankrd23Q812A3 306 aa28.65■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 PappaQ8R4K8 1624 aa28.64■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Shank3Q4ACU6 1730 aa28.64■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa28.64■■■□□ 2.18
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Adam1aQ60813 791 aa28.63■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcmdc2E9Q956 681 aa28.62■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.61■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa28.61■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 GorabQ8BRM2 368 aa28.61■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim52Q8CDV4 233 aa28.61■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankle2Q6P1H6 964 aa28.6■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tceal9Q9DD24 104 aa28.6■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dnai1Q8C0M8 701 aa28.59■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Soga3Q6NZL0 945 aa28.59■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bsdc1Q80Y55 427 aa28.59■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kif2cQ922S8 721 aa28.59■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hmox1P14901 289 aa28.58■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm12185Q5NCB2 835 aa28.58■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dcaf5Q80T85 946 aa28.58■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ets1P27577 440 aa28.58■■■□□ 2.17
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fer1l6E0CZ42 1862 aa28.57■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prune1Q8BIW1 454 aa28.57■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fkbp5Q64378 456 aa28.57■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa28.57■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ripor2Q80U16 1078 aa28.57■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ginm1Q91WR6 327 aa28.57■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nwd2Q6P5U7 1742 aa28.56■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Morc2aQ69ZX6 1030 aa28.56■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa28.55■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pm20d1Q8C165 503 aa28.55■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sema6bO54951 886 aa28.55■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcm2P97310 904 aa28.55■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Adora1Q60612 326 aa28.54■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppm1gQ61074 542 aa28.54■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slfnl1Q8BHW9 410 aa28.54■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa28.54■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zbtb45Q52KG4 520 aa28.53■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 MypopQ8R4U1 393 aa28.53■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmc1Q8R4P5 757 aa28.53■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q9D2X8 372 aa28.53■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 GpkowQ56A08 488 aa28.52■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nlrp9bQ66X22 1003 aa28.52■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nyap1Q6PFX7 833 aa28.52■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nav1Q8CH77 1875 aa28.52■■■□□ 2.16
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 CenppQ9CZ92 286 aa28.51■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igflr1Q3U4N7 345 aa28.51■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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