RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aifm3Q3TY86 605 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg3Q9CPX6 314 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cap2Q9CYT6 476 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pnmal2G3X9N3 661 aa28.87■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shank3Q4ACU6 1730 aa28.87■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tm6sf1P58749 370 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim27Q62158 513 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BcorQ8CGN4 1759 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cgnl1Q6AW69 1298 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prkab2Q6PAM0 271 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SympkQ80X82 1284 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CoilQ5SU73 570 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mre11Q61216 706 aa28.84■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fbln2P37889 1221 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aldh8a1Q8BH00 487 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Flad1Q8R123 492 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dcaf5Q80T85 946 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cyp2d11P24457 504 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rabep1O35551 862 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Jmjd4Q8BFT6 427 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrit1Q8K099 624 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppfibp2O35711 882 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Disp3A3KFU9 1347 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Morc2aQ69ZX6 1030 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cog6Q8R3I3 657 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klc3Q91W40 508 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gcc1Q9D4H2 778 aa28.76■■■□□ 2.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc39a6Q8C145 765 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adcy9P51830 1353 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr63B2RY71 923 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mylk2Q8VCR8 613 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcm2P97310 904 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Echdc1Q9D9V3 322 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igfbp6P47880 238 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fgd1P52734 960 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam13aQ8BGI4 693 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abca3Q8R420 1704 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prkar2bP31324 416 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Triml2E9PW10 424 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ly75Q60767 1723 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col4a1P02463 1669 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Syde2E9PUP1 1314 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Clcn1Q64347 994 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubap1lG3UW59 384 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nav1Q8CH77 1875 aa28.7■■■□□ 2.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Flt4P35917 1363 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cers3Q1A3B0 383 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm12185Q5NCB2 835 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sugp2Q8CH09 1067 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sos2Q02384 1333 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Irf9Q61179 399 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ttll7A4Q9F0 912 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pde4dQ01063 747 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgap33Q80YF9 1305 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Erbb4Q61527 1308 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trim52Q8CDV4 233 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kndc1Q0KK55 1742 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GalcP54818 684 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stk36Q69ZM6 1316 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k2Q61083 619 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Exoc6bA6H5Z3 810 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 FanclQ9CR14 375 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bicdl1A0JNT9 577 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hoxa7P02830 229 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankle2Q6P1H6 964 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MetP16056 1379 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Miga2Q8BK03 593 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kif2cQ922S8 721 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CenppQ9CZ92 286 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ric1Q69ZJ7 1422 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bend3Q6PAL0 825 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hspa2P17156 633 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zbtb1Q91VL9 713 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppm1mQ8BU27 406 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10093D3YYI8 482 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.1 ms