RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bloc1s4Q8VED2 215 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Btbd11Q6GQW0 1109 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam83gQ5SWY7 812 aa25.27■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GorabQ8BRM2 368 aa25.27■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa25.27■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SlkO54988 1233 aa25.26■■□□□ 1.63
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fez1Q8K0X8 392 aa25.26■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhd1B2RPU2 505 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Irx6Q9ER75 438 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BcorQ8CGN4 1759 aa25.24■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acsbg1Q99PU5 721 aa25.24■■□□□ 1.63
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col1a2Q01149 1372 aa25.23■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa25.23■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chmp7Q8R1T1 451 aa25.22■■□□□ 1.63
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FanclQ9CR14 375 aa25.22■■□□□ 1.63
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnpla7A2AJ88 1352 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rasa1E9PYG6 1038 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zpr1Q62384 459 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prkar2bP31324 416 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erc2Q6PH08 957 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam50bQ9WTJ8 334 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Disp3A3KFU9 1347 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CoilQ5SU73 570 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc155Q80VJ8 648 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fkbp4P30416 458 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa25.15■■□□□ 1.62
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slx1bQ8BX32 270 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp6v1dP57746 247 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VgfQ0VGU4 617 aa25.13■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem119Q8R138 280 aa25.12■■□□□ 1.61
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atg4aQ8C9S8 396 aa25.11■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa25.11■■□□□ 1.61
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GckrQ91X44 587 aa25.11■■□□□ 1.61
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Echdc1Q9D9V3 322 aa25.1■■□□□ 1.61
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ssfa2Q922B9 1252 aa25.09■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Taf7Q9R1C0 341 aa25.09■■□□□ 1.61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2d11P24457 504 aa25.09■■□□□ 1.61
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gse1Q3U3C9 1213 aa25.07■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stk36Q69ZM6 1316 aa25.07■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm45015A0A140LII9 184 aa25.06■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm18336A0A140LIU8 765 aa25.06■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MccE9PWI3 1003 aa25.06■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl2l13P59017 434 aa25.06■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa25.04■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7361D3Z6R1 267 aa25.04■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa25.04■■□□□ 1.6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm1979E9QAN3 267 aa25.04■■□□□ 1.6
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10220K7N660 267 aa25.04■■□□□ 1.6
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