RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q STE11P23561 717 aa3.74□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSM24Q03976 319 aa3.74□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q PNS1Q12412 539 aa3.74□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALG3P38179 458 aa3.73□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q RFC5P38251 354 aa3.73□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q DUS4Q06063 367 aa3.73□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPO21Q12411 609 aa3.73□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM2P33753 639 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q RGD1P38339 666 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAA3P39002 694 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q PIC2P40035 300 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPS18P42847 217 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR122WP53272 402 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIW14P53965 281 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q RXT3Q07458 294 aa3.72□□□□□ -1.81
tW(UCA)QtW(UCA)Q KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIZ1Q04195 904 aa3.71□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q TOS4Q06266 489 aa3.71□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG13Q06628 738 aa3.71□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRE9P23638 258 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPT1P33299 467 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPB2P39717 880 aa3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q MNN10P50108 393 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q PUS9Q12069 462 aa3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q WHI5Q12416 295 aa3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAD3Q9URQ3 322 aa3.7□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC20P26309 610 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q MKK2P32491 506 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q THI12P42883 340 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q THI5P43534 340 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q THI11P47183 340 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q ROT1Q03691 256 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q THI13Q07748 340 aa3.69□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q DED1P06634 604 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC8P32855 1065 aa3.68□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSE1P48525 536 aa3.68□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q PLB2Q03674 706 aa3.68□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPB1Q08886 897 aa3.68□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q SVS1Q12254 260 aa3.68□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAL10P04397 699 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC6P09119 513 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q CMP2P14747 604 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q HCM1P25364 564 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q SYP1P25623 870 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q PMI40P29952 429 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLD2P34252 453 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q CNN1P43618 361 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS62P53285 467 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q ROD1Q02805 837 aa3.67□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD2P07276 1031 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRM1P21827 482 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q LST4P34239 828 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT13P39924 564 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRT14P40470 206 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q GNP1P48813 663 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT17P53631 564 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT15P54854 567 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP12Q08208 459 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q NTO1Q12311 748 aa3.66□□□□□ -1.82
tW(UCA)QtW(UCA)Q THS1P04801 734 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q CYC8P14922 966 aa3.65□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBP5P20449 482 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCM6P53091 1017 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSC2Q03455 724 aa3.65□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER152CP10356 443 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q APL1P27351 700 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MLS1P30952 554 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q DCG1P32460 244 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGE1P38523 228 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q GEM1P39722 662 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q IOC3P43596 787 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTF4Q01454 927 aa3.64□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACE2P21192 770 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q BAS1P22035 811 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPH1P40562 993 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRL1Q06815 381 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data3.63□□□□□ -1.83not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACM1Q08981 209 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMI1Q12039 706 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q GNT1Q12096 491 aa3.63□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD27P26793 382 aa3.62□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM21P40563 679 aa3.62□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR224WQ05947 369 aa3.62□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q TMA10Q06177 86 aa3.62□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q EMC1P25574 760 aa3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q IPL1P38991 367 aa3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLI1P53304 468 aa3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data3.61□□□□□ -1.83not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAP6Q03935 383 aa3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTT10Q08924 1013 aa3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCR1P07261 785 aa3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.6 ms