RNA–Protein interactions for RNA: YNL109W

YNL109W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL109W, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL109W	YNL109W	BAP2	P38084	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	PIK1	P39104	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	GNP1	P48813	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	RSB1	Q08417	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SPO21	Q12411	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SPS1	P08458	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	AIM26	P32858	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	PET112	P33893	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	HXT13	P39924	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	UBP5	P39944	805 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	HNT2	P49775	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	HXT17	P53631	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	HXT15	P54854	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SVF1	Q05515	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SNO2	P53823	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	MLS1	P30952	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	RER2	P35196	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	GPB2	P39717	880 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	MRPL22	P53881	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL109W	YNL109W	CDC34	P14682	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	SNF5	P18480	905 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	CLN2	P20438	545 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	RNQ1	P25367	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	GNT1	Q12096	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	LYP1	P32487	611 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	MET10	P39692	1035 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	MPH1	P40562	993 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	CDA2	Q06703	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	MCM7	P38132	845 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	RSM24	Q03976	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	YER152C	P10356	443 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	RFC5	P38251	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	GEM1	P39722	662 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	TYW3	P53177	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	RIM8	P53179	542 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	SPO20	Q04359	397 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	RKM4	Q12504	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	SOD2	P00447	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	DUT1	P33317	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	ATG13	Q06628	738 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	MAD1	P40957	749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
YNL109W	YNL109W	SGD1	Q06132	899 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	ACM1	Q08981	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL109W	YNL109W	BAS1	P22035	811 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
YNL109W	YNL109W	RRT14	P40470	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	YGR053C	P53234	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	SVS1	Q12254	260 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	YKL107W	P34251	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	PNT1	P38969	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	EEB1	Q02891	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	INO1	P11986	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	SCT1	P32784	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	THI80	P35202	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	UGA2	P38067	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	LAM1	P38851	1228 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	CWC24	P53769	259 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	PIN2	Q12057	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	YLR358C	O13565	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	APL1	P27351	700 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	ACE2	P21192	770 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	MEF2	P39677	819 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	MXR1	P40029	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	YGL176C	P46945	554 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	ESC8	Q08119	714 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	DOM34	P33309	386 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	SLA2	P33338	968 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	TOD6	P34219	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	VPS16	Q03308	798 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	GCN5	Q03330	439 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL109W	YNL109W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms