RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	HPF1	Q05164	967 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	CAN1	P04817	590 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	MLS1	P30952	554 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	NNK1	P36003	928 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	ALR2	P43553	858 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	RRM3	P38766	723 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	MNN1	P39106	762 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	MBP1	P39678	833 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	TAF8	Q03750	510 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	IOC4	Q04213	475 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	NFS1	P25374	497 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	SPO21	Q12411	609 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TRZ1	YKR079C	AI1	P03875	834 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	THI4	P32318	326 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	CCC2	P38995	1004 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	BOI2	P39969	1040 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.84	not detected
TRZ1	YKR079C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	UBX5	Q06682	500 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	ERR1	P0CX10	437 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	ERR2	P0CX11	437 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	CDC11	P32458	415 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	SFA1	P32771	386 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YGL081W	P53156	320 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YNR014W	P53719	212 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	KIP1	P28742	1111 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RTA1	P53047	317 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	NCE103	P53615	221 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
TRZ1	YKR079C	PNT1	P38969	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YER152C	P10356	443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RSC6	P25632	483 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GPT2	P36148	743 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YDR306C	Q06640	478 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	MSH2	P25847	964 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YJL045W	P47052	634 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	BET3	P36149	193 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	SIT1	P39980	628 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	ALT1	P52893	592 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	TNA1	P53322	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	AI3	P03877	415 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	PPH3	P32345	308 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GPB2	P39717	880 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YJR142W	P47173	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	TPP1	Q03796	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	ACM1	Q08981	209 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	COQ4	O13525	335 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	BUD9	P53226	547 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GIC2	Q06648	383 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	DOM34	P33309	386 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GDH3	P39708	457 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GEM1	P39722	662 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	UGO1	Q03327	502 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	GAS5	Q08193	484 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	NTG2	Q08214	380 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	PET10	P36139	283 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YSC84	P32793	468 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	SLA2	P33338	968 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TRZ1	YKR079C	ADE8	P04161	214 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	TRK2	P28584	889 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	PRO1	P32264	428 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TRZ1	YKR079C	CCZ1	P38273	704 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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