RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	LYP1	P32487	611 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	MDL2	P33311	773 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	VPS16	Q03308	798 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.85	□□□□□ -1.47	not detected
YKR070W	YKR070W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	AOS1	Q06624	347 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.84	□□□□□ -1.47	not detected
YKR070W	YKR070W	DUT1	P33317	147 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	CCZ1	P38273	704 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	PEX7	P39108	375 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	VAC8	P39968	578 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	HNT2	P49775	206 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR070W	YKR070W	AIM26	P32858	118 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	TNA1	P53322	534 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.83	□□□□□ -1.48	not detected
YKR070W	YKR070W	RSB1	Q08417	382 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	INO1	P11986	533 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	CTH1	P47976	325 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	YGR053C	P53234	283 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	EEB1	Q02891	456 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	SAM35	P14693	329 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	HSP78	P33416	811 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	YER152C	P10356	443 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	BAS1	P22035	811 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	YKL107W	P34251	309 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	MPH1	P40562	993 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	GNT1	Q12096	491 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	RKM4	Q12504	494 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	PRI2	P20457	528 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	YGL176C	P46945	554 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	RSC58	Q07979	502 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	SPS1	P08458	490 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YKR070W	YKR070W	SEA4	P38164	1038 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	PIK1	P39104	1066 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	OPI10	Q08202	246 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
YKR070W	YKR070W	BAP2	P38084	609 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	MXR1	P40029	184 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	ESC2	Q06340	456 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	DFG16	Q99234	619 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	SWR1	Q05471	1514 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	SNF5	P18480	905 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	YFL054C	P43549	646 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	YOR352W	Q08816	343 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	ECL1	P48235	211 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	ORC3	P54790	616 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	ACM1	Q08981	209 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	AGP1	P25376	633 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	LRG1	P35688	1017 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	UGA2	P38067	497 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	RFC5	P38251	354 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	GEM1	P39722	662 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	AVT1	P47082	602 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YKR070W	YKR070W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SVS1	Q12254	260 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SEG2	P34250	1132 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	YKL069W	P36088	180 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	VBA5	P36172	582 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	PNT1	P38969	423 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	ENV11	P53246	860 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	MBP1	P39678	833 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
YKR070W	YKR070W	RSM24	Q03976	319 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SHE9	Q04172	456 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	MRP8	P35719	219 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	BI4	P03879	638 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YKR070W	YKR070W	APL1	P27351	700 aa		5.67	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms