RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	ELM1	P32801	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	AIM26	P32858	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	GPB2	P39717	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	AOS1	Q06624	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	RSC58	Q07979	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SEG2	P34250	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	RER2	P35196	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	ENV11	P53246	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SVF1	Q05515	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	CDC34	P14682	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	MLS1	P30952	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	BAP2	P38084	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	PIK1	P39104	1066 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	NIT1	P40447	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	HNT2	P49775	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	RSB1	Q08417	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SPS1	P08458	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	CLN2	P20438	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	MET10	P39692	1035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	MPH1	P40562	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SNF5	P18480	905 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	LYP1	P32487	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	DUT1	P33317	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	MCM7	P38132	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	GNT1	Q12096	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	YER152C	P10356	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	MAD1	P40957	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	TYW3	P53177	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	SNO2	P53823	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJR087W	YJR087W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RNQ1	P25367	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	MRPL22	P53881	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YJR087W	YJR087W	SPO20	Q04359	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	UBP5	P39944	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YGR053C	P53234	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	EEB1	Q02891	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RKM4	Q12504	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	CWC24	P53769	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	CDA2	Q06703	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	INO1	P11986	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	BAS1	P22035	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RFC5	P38251	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	GEM1	P39722	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RSM24	Q03976	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	ACM1	Q08981	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YKL107W	P34251	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	VPS16	Q03308	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YJR087W	YJR087W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	UGA2	P38067	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	PNT1	P38969	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	MXR1	P40029	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YFL054C	P43549	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	RIM8	P53179	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	ATG13	Q06628	738 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	SVS1	Q12254	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YGL176C	P46945	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	SGD1	Q06132	899 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJR087W	YJR087W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	SOD2	P00447	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	APL1	P27351	700 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	RRT14	P40470	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	ACE2	P21192	770 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	SLA2	P33338	968 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
YJR087W	YJR087W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	AGP1	P25376	633 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	LAM1	P38851	1228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJR087W	YJR087W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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