RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SPO13	YHR014W	AFG2	P32794	780 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPO13	YHR014W	SPO21	Q12411	609 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPO13	YHR014W	ATE1	P16639	503 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO13	YHR014W	PIC2	P40035	300 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO13	YHR014W	SIW14	P53965	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO13	YHR014W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RGD1	P38339	666 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RSM24	Q03976	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RAD2	P07276	1031 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
SPO13	YHR014W	SEC8	P32855	1065 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RFC5	P38251	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	LAM1	P38851	1228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	GPB2	P39717	880 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	POL32	P47110	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	SPT20	P50875	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	GCN5	Q03330	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	CYC8	P14922	966 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	SNF5	P18480	905 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RAD27	P26793	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	HEM3	P28789	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	MKK2	P32491	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	DOM34	P33309	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	MEF2	P39677	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	CNN1	P43618	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	ROD1	Q02805	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	MRL1	Q06815	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	TAT2	P38967	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SPO13	YHR014W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	RXT3	Q07458	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	MCM2	P29469	868 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	ASF1	P32447	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	FYV10	P40492	516 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	YJR107W	P47145	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO13	YHR014W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	CTS1	P29029	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	RMD1	Q03441	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	SPR28	Q04921	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	ATG13	Q06628	738 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	SVS1	Q12254	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	CMP2	P14747	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	MLS1	P30952	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	ROT1	Q03691	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	STE11	P23561	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	APL1	P27351	700 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	HXT13	P39924	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	GNP1	P48813	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	HXT17	P53631	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	HXT15	P54854	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	GNT1	Q12096	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	GAL10	P04397	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	GCR1	P07261	785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	YER152C	P10356	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	RRT14	P40470	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	DUS4	Q06063	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	GPB1	Q08886	897 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	BAS1	P22035	811 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	PEP7	P32609	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	TRM2	P33753	639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	GEM1	P39722	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	MPH1	P40562	993 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	ACM1	Q08981	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	PNS1	Q12412	539 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	MCM7	P38132	845 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPO13	YHR014W	CDC20	P26309	610 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO13	YHR014W	UGA2	P38067	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO13	YHR014W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SPO13	YHR014W	PLB2	Q03674	706 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPO13	YHR014W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SPO13	YHR014W	ACE2	P21192	770 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO13	YHR014W	RER2	P35196	286 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SPO13	YHR014W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SPO13	YHR014W	MSC2	Q03455	724 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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