RNA–Protein interactions for RNA: YGR248W

SOL4, Transcript of 6-phosphogluconolactonase, yeast

Gene SOL4, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOL4	YGR248W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	CHS2	P14180	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	MCM2	P29469	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	SWC3	P31376	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	PAN5	P38787	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RGD2	P43556	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	ALD3	P54114	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YML083C	Q04526	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	REC8	Q12188	680 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	SMC1	P32908	1225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	MIC60	P36112	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YKR073C	P36153	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RSM25	P40496	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	IRC24	P40580	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	NSE3	Q05541	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	APC1	P53886	1748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TRP3	P00937	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	MRP7	P12687	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RAD4	P14736	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	DID4	P36108	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TFA2	P36145	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RMD1	Q03441	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SOL4	YGR248W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SOL4	YGR248W	KTR2	P33550	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RAD55	P38953	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	CTF4	Q01454	927 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	ESC2	Q06340	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	AIM44	Q99299	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	KCC4	P25389	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TOS1	P38288	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	AKR1	P39010	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TPM2	P40414	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	SPO74	P45819	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	ZDS2	P54786	942 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	PEX19	Q07418	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	LYS2	P07702	1392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	LIP5	P32875	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	PSY2	P40164	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	YGR130C	P53278	816 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	NCE103	P53615	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	SSL2	Q00578	843 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	RIM20	Q12033	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	ELG1	Q12050	791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SOL4	YGR248W	PDR18	P53756	1333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	QCR6	P00127	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	CYC8	P14922	966 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	NUP133	P36161	1157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	NEO1	P40527	1151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	NCB2	Q92317	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	RPB10	P22139	70 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MBR1	P23493	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ELM1	P32801	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MRPL10	P36520	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	NPR3	P38742	1146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	STU2	P46675	888 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	YJR124C	P47159	448 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	MRPS35	P53292	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	FAR11	P53917	953 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	TIM50	Q02776	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	ALE1	Q08548	619 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	SLM3	Q12093	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	GLO4	Q12320	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SOL4	YGR248W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.5 ms