RNA–Protein interactions for RNA: YER117W

RPL23B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L23B, yeastyeast

Gene RPL23B, Length 414 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL23BYER117W BRN1P38170 754 aa3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W BIM1P40013 344 aa3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W FIG4P42837 879 aa3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SOL4P53315 255 aa3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ULP1Q02724 621 aa3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RKM4Q12504 494 aa3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RAD18P10862 487 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SUP45P12385 437 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W UTR4P32626 227 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MAC1P35192 417 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RER2P35196 286 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MYO3P36006 1272 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SIS2P36024 562 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YKR018CP36114 725 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W VPS45P38932 577 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W VPS62P53285 467 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W HXT17P53631 564 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W FOL1P53848 824 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YNL108CP53929 270 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YAF9P53930 226 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W HDA1P53973 706 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W DUS4Q06063 367 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W FRA1Q07825 749 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MET7Q08645 548 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MCM16Q12262 181 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YOR131CQ12486 218 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TUS1Q06412 1307 aa3.37□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W NUC1P08466 329 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TIF1P10081 395 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W AFT1P22149 690 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W PEP3P27801 918 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W BIO2P32451 375 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MRT4P33201 236 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SHP1P34223 423 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W LDH1P38139 375 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
RPL23BYER117W PES4P39684 611 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W GPB2P39717 880 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W HXT13P39924 564 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W CSM2P40465 213 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SLD5Q03406 294 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W EST2Q06163 884 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TFC6Q06339 672 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SUE1Q06524 206 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RLF2Q12495 606 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W VPS13Q07878 3144 aa3.36□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MYO1P08964 1928 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
RPL23BYER117W MAK31P23059 88 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W DLD1P32891 587 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W NDT80P38830 627 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MXR1P40029 184 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ATG32P40458 529 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W EMW1P42842 904 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ALG2P43636 503 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YJR107WP47145 328 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YGR125WP53273 1036 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W LSB1P53281 241 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ARP5P53946 755 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ICL2Q12031 575 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.35□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W CIT1P00890 479 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W ENO2P00925 437 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W RGT1P32862 1170 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TGL1P34163 548 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W TPM2P40414 161 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W VID28P40547 921 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W VPS53P47061 822 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MDM1Q01846 1127 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SPH1Q06160 661 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YPR084WQ06821 456 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SUT2Q12286 268 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W YOR111WQ99210 232 aa3.34□□□□□ -1.87
RPL23BYER117W SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.3 ms