RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.6□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.6□□□□□ -0.87
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 CYP27B1O15528 508 aa9.6□□□□□ -0.87
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-218ENST00000628742 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 SMIM5Q71RC9 77 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.47□□□□□ -0.89
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.46□□□□□ -0.89
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDCA8Q53HL2 280 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KLRG1Q96E93 195 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POLKQ9UBT6 870 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RPS6KA4O75676 772 aa9.45□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PHF14O94880 888 aa9.45□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.45□□□□□ -0.9
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