RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BTAF1O14981 1849 aa25.63■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NGEFQ8N5V2 710 aa25.6■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.6■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.59■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC39A6Q13433 755 aa25.58■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF521Q96K83 1311 aa25.58■■□□□ 1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BTBD11A6QL63 1104 aa25.57■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATG3Q9NT62 314 aa25.57■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APBA3O96018 575 aa25.56■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNQ3O43525 872 aa25.55■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR63Q8IWG1 891 aa25.54■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PAPPAQ13219 1627 aa25.53■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF790Q6PG37 636 aa25.52■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CFAP44Q96MT7 982 aa25.52■■□□□ 1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHL1O00533 1208 aa25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF853P0CG23 659 aa25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IFT57Q9NWB7 429 aa25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PALLDQ8WX93 1383 aa25.51■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GNAI1P63096 354 aa25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC125Q86Z20 511 aa25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MBIPQ9NS73 344 aa25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL16Q14005 1332 aa25.49■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.48■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA2Q08379 1002 aa25.48■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.48■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LY75O60449 1722 aa25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLSCR1O15162 318 aa25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.47■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNQ4P56696 695 aa25.46■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.46■■□□□ 1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PROM2Q8N271 834 aa25.45■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.44■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BAG6P46379 1132 aa25.44■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIK1P57059 783 aa25.44■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.43■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.43■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLFN5Q08AF3 891 aa25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TXNRD1Q16881 649 aa25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT24Q2M2I5 525 aa25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 E9PSI1 815 aa25.41■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.41■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.4■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP6V1AP38606 617 aa25.4■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.4■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.4■■□□□ 1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITPK1Q13572 414 aa25.39■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TJP1Q07157 1748 aa25.37■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.37■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.37■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C5P01031 1676 aa25.37■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.36■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.36■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.36■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.36■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.35■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPYL6Q8N831 410 aa25.35■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RREB1Q92766 1687 aa25.34■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.34■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP16Q9Y5T5 823 aa25.34■■□□□ 1.65
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.3■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SOCS7O14512 581 aa25.3■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms