RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 EPAS1Q99814 870 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 FCHSD2O94868 740 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 CABP1Q9NZU7 370 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 MLECQ14165 292 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF428Q96B54 188 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF16BQ96L93 1317 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 PDIA6Q15084 440 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 PANK1Q8TE04 598 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 COG6Q9Y2V7 657 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP12Q02952 1782 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 METP08581 1390 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS3P49796 1198 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 C3P01024 1663 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 DIP2AQ14689 1571 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 RIPK4P57078 832 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf34Q49A92 452 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 COG3Q96JB2 828 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 USP35Q9P2H5 1018 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-222ENST00000592408 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.548e-7■■□□□ 12.8
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 TSKSQ9UJT2 592 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 NFE2L2Q16236 605 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf80F5H4A9 247 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKAR2BP31323 418 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 E2F4Q16254 413 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 IFFO2Q5TF58 517 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 POLKQ9UBT6 870 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 SLIT1O75093 1534 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K7O43318 606 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHDP01880 384 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAI1P63096 354 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT57Q9NWB7 429 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 WBP1LQ9NX94 342 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 EID1Q9Y6B2 187 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 PTCH1Q13635 1447 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0G2JS52 829 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 RLBP1P12271 317 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 BECN1Q14457 450 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 SKAP1Q86WV1 359 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 NME9Q86XW9 330 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM27P14373 513 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 IL13P35225 146 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms