RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
RNPS1-222ENST00000567147 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
RNPS1-222ENST00000567147 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.81■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 KIF3CO14782 793 aa23.81■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.79■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 SIK1P57059 783 aa23.79■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 SSFA2P28290 1259 aa23.78■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 GNPATO15228 680 aa23.77■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 ITPK1Q13572 414 aa23.77■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.77■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.77■■□□□ 1.4
RNPS1-222ENST00000567147 PHKG2P15735 406 aa23.76■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 MTHFSP49914 203 aa23.76■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 MMP10P09238 476 aa23.75■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 IL13P35225 146 aa23.74■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.74■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 ATP6V1AP38606 617 aa23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.72■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 BCS1LQ9Y276 419 aa23.72■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 A0A0G2JLW4 131 aa23.71■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.7■■□□□ 1.39
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 ATG3Q9NT62 314 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 APLP1P51693 650 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 DCAF5Q96JK2 942 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 TOMM70O94826 608 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-222ENST00000567147 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 DPEP1P16444 411 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 KDRP35968 1356 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 TGFB2P61812 414 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 FCHSD2O94868 740 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 HMOX1P09601 288 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 HTRA3P83110 453 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 C4AP0C0L4 1744 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.61■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 WDR90Q96KV7 1748 aa23.6■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 CABP4P57796 275 aa23.6■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.59■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 GYS1P13807 737 aa23.58■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.58■■□□□ 1.37
RNPS1-222ENST00000567147 RFC4P35249 363 aa23.57■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.57■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 KCNA3P22001 575 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 RPS6KA4O75676 772 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 ADRA2BP18089 450 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 LGR6Q9HBX8 967 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-222ENST00000567147 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 CFAP53Q96M91 514 aa23.5■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 PIM2Q9P1W9 311 aa23.5■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 PPP2R1AP30153 589 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 CHRNA5P30532 468 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 KLRG1Q96E93 195 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 RRAGCQ9HB90 399 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 RNF181Q9P0P0 153 aa23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 CAPN15O75808 1086 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 DDR1Q08345 913 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-222ENST00000567147 FKBP8Q14318 412 aa23.48■■□□□ 1.35
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