RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC15A2Q16348 729 aa29.45■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.45■■■□□ 2.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.44■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNQ4P56696 695 aa29.44■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.43■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.43■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.42■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIK1P57059 783 aa29.42■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.41■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.41■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CASZ1Q86V15 1759 aa29.4■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF827Q17R98 1081 aa29.4■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL17REQ8NFR9 667 aa29.4■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKT1S1Q96B36 256 aa29.4■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TEFQ10587 303 aa29.38■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.37■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C4BP0C0L5 1744 aa29.37■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRP5O75197 1615 aa29.36■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFE2L2Q16236 605 aa29.36■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.36■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP6V1AP38606 617 aa29.35■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.33■■■□□ 2.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.32■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITPK1Q13572 414 aa29.32■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.32■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCPQ6ZWJ8 1503 aa29.31■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RUNDC1Q96C34 613 aa29.31■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.31■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MCM10Q7L590 875 aa29.3■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.3■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TJP1Q07157 1748 aa29.29■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC39A6Q13433 755 aa29.29■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC184Q52MB2 194 aa29.29■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AK7Q96M32 723 aa29.29■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.28■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.28■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC5Q8N0Z6 440 aa29.28■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCTN1Q14203 1278 aa29.27■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRS2Q9HD23 443 aa29.27■■■□□ 2.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.26■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF790Q6PG37 636 aa29.25■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BTBD11A6QL63 1104 aa29.24■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.24■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.24■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPON1Q9HCB6 807 aa29.24■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.23■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIPK4P57078 832 aa29.23■■■□□ 2.27
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.22■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.22■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTFR1LQ9H019 292 aa29.21■■■□□ 2.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNPATO15228 680 aa29.2■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB7AO95365 584 aa29.2■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSFA2P28290 1259 aa29.2■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSH5O43196 834 aa29.15■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHF14O94880 888 aa29.15■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEUROD2Q15784 382 aa29.15■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.15■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.14■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNQ3O43525 872 aa29.14■■■□□ 2.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS6KA4O75676 772 aa29.13■■■□□ 2.25
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADRA2BP18089 450 aa29.12■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APAF1O14727 1248 aa29.11■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTGER2P43116 358 aa29.11■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.11■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.11■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STARD3NLO95772 234 aa29.1■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMIM5Q71RC9 77 aa29.09■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.09■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C4AP0C0L4 1744 aa29.08■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.08■■■□□ 2.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.08■■■□□ 2.25
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