RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K5Q99683 1374 aa24.8■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.8■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 LRP5O75197 1615 aa24.79■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB7AO95365 584 aa24.79■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 ITPK1Q13572 414 aa24.79■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 C5P01031 1676 aa24.78■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP6V1AP38606 617 aa24.78■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 IL17REQ8NFR9 667 aa24.78■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.78■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.78■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.77■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 SPON1Q9HCB6 807 aa24.77■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.77■■□□□ 1.56
GCSHP2-201ENST00000560971 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 MRC1P22897 1456 aa24.76■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.75■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.75■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC39A6Q13433 755 aa24.74■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.74■■□□□ 1.55
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GCSHP2-201ENST00000560971 C4BP0C0L5 1744 aa24.72■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 SMIM5Q71RC9 77 aa24.72■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.72■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 AK7Q96M32 723 aa24.72■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 MTFR1LQ9H019 292 aa24.71■■□□□ 1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.7■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 NEFMP07197 916 aa24.7■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 TEFQ10587 303 aa24.7■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 MCM10Q7L590 875 aa24.7■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.69■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 MSH5O43196 834 aa24.69■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 PTGER2P43116 358 aa24.69■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 DCTN1Q14203 1278 aa24.68■■□□□ 1.54
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GCSHP2-201ENST00000560971 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF14O94880 888 aa24.67■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.66■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.66■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 GNPATO15228 680 aa24.66■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.66■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 NFE2L2Q16236 605 aa24.65■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.65■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.65■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
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GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.64■■□□□ 1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.63■■□□□ 1.53
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GCSHP2-201ENST00000560971 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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GCSHP2-201ENST00000560971 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 BTBD11A6QL63 1104 aa24.62■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SSFA2P28290 1259 aa24.62■■□□□ 1.53
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GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF790Q6PG37 636 aa24.62■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.62■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.61■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TJP1Q07157 1748 aa24.61■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNQ3O43525 872 aa24.61■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 MSL1Q68DK7 614 aa24.61■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ANP32CO43423 234 aa24.6■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.58■■□□□ 1.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.58■■□□□ 1.53
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GCSHP2-201ENST00000560971 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 RIPK4P57078 832 aa24.57■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.57■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 RUNDC1Q96C34 613 aa24.57■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.56■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ARXQ96QS3 562 aa24.56■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.56■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 POLD1P28340 1107 aa24.55■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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GCSHP2-201ENST00000560971 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.54■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NEUROD2Q15784 382 aa24.54■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.54■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.54■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.53■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ADRA2BP18089 450 aa24.51■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 RFC4P35249 363 aa24.5■■□□□ 1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.5■■□□□ 1.51
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