RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.14■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.13■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.13■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAP3K5Q99683 1374 aa22.12■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.12■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 SSFA2P28290 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 CASC1Q6TDU7 716 aa22.11■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PIK3C2AO00443 1686 aa22.1■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 BTBD11A6QL63 1104 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PDE1AP54750 535 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 KDRP35968 1356 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.09■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 DTNBO60941 627 aa22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GRAMD2B-218ENST00000542322 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 PANK2Q9BZ23 570 aa22.08■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.08■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 GCP02774 474 aa22.07■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 IP6K1Q92551 441 aa22.07■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP26Q9BXU7 913 aa22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 PKP1Q13835 747 aa22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP44Q9H0E7 712 aa22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 SRGAP3O43295 1099 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 GNAI3P08754 354 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLIT1O75093 1534 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 AK9Q5TCS8 1911 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC39A6Q13433 755 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.05■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 MX1P20591 662 aa22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.04■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 PROSER3Q2NL68 480 aa22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 SNX21Q969T3 373 aa22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.02■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 NEK4P51957 841 aa22.02■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHRNA2Q15822 529 aa22.02■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GRAMD2B-218ENST00000542322 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.02■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 ERC2O15083 957 aa22.01■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 MYL6BP14649 208 aa22.01■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 NALCNQ8IZF0 1738 aa22■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 ATP8B2P98198 1209 aa22■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 MCTP1Q6DN14 999 aa21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 GBP4Q96PP9 640 aa21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 REC8O95072 547 aa21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 PALD1Q9ULE6 856 aa21.99■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 RABEP1Q15276 862 aa21.98■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.97■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 SIL1Q9H173 461 aa21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 IL25Q9H293 177 aa21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 ST18O60284 1047 aa21.96■■□□□ 1.11
GRAMD2B-218ENST00000542322 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.95■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.95■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.92■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.92■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
GRAMD2B-218ENST00000542322 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms