RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533708.1

RAB30-AS1-207, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB30-AS1, Length 825 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TEFQ10587 303 aa20.74■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.73■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TRIM37O94972 964 aa20.72■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WDR63Q8IWG1 891 aa20.72■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.72■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF853P0CG23 659 aa20.71■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.71■□□□□ 0.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 IL16Q14005 1332 aa20.7■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CHL1O00533 1208 aa20.69■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLC39A6Q13433 755 aa20.69■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CFAP44Q96MT7 982 aa20.69■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PAPPAQ13219 1627 aa20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BTBD11A6QL63 1104 aa20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KCNQ3O43525 872 aa20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 IFT57Q9NWB7 429 aa20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.68■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BTAF1O14981 1849 aa20.67■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.67■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ATG3Q9NT62 314 aa20.67■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GOLGA2Q08379 1002 aa20.66■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MBIPQ9NS73 344 aa20.66■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.66■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.65■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GNAI1P63096 354 aa20.65■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF790Q6PG37 636 aa20.65■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.65■□□□□ 0.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLFN5Q08AF3 891 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PALLDQ8WX93 1383 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 E9PSI1 815 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 APBA3O96018 575 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KRT24Q2M2I5 525 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LY75O60449 1722 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PLSCR1O15162 318 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SIK1P57059 783 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PROM2Q8N271 834 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.55■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KCNQ4P56696 695 aa20.54■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CCDC125Q86Z20 511 aa20.54■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TSPYL6Q8N831 410 aa20.54■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ITPK1Q13572 414 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TJP1Q07157 1748 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 C5P01031 1676 aa20.52■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TXNRD1Q16881 649 aa20.52■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ATP6V1AP38606 617 aa20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BAG6P46379 1132 aa20.5■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 USP16Q9Y5T5 823 aa20.5■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.49■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 HOXB7P09629 217 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.48■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 VAMP4O75379 141 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.46■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RREB1Q92766 1687 aa20.45■□□□□ 0.86
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.5 ms