RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TXNRD1Q16881 649 aa21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PALLDQ8WX93 1383 aa21.82■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIGBQ92521 554 aa21.81■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PROM2Q8N271 834 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CABP4P57796 275 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NBPF14Q5TI25 921 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.79■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASZ1Q86V15 1759 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C4BP0C0L5 1744 aa21.74■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NFE2L2Q16236 605 aa21.73■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LGR6Q9HBX8 967 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATG3Q9NT62 314 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.72■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIK1P57059 783 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TEFQ10587 303 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STK32BQ9NY57 414 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TJP1Q07157 1748 aa21.71■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.7■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRP5O75197 1615 aa21.7■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL17REQ8NFR9 667 aa21.7■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RUNDC1Q96C34 613 aa21.7■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC15A2Q16348 729 aa21.69■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRS2Q9HD23 443 aa21.69■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.69■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.69■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.68■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAPN15O75808 1086 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AKT1S1Q96B36 256 aa21.66■■□□□ 1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP6V1AP38606 617 aa21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF827Q17R98 1081 aa21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC184Q52MB2 194 aa21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.63■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MCM10Q7L590 875 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.62■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNQ4P56696 695 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RIPK4P57078 832 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF790Q6PG37 636 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.61■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BTBD11A6QL63 1104 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITPK1Q13572 414 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.6■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AK7Q96M32 723 aa21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.59■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC39A6Q13433 755 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCTN1Q14203 1278 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.58■■□□□ 1.05
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.58■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCER2I3L3R5 266 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C4AP0C0L4 1744 aa21.57■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SSFA2P28290 1259 aa21.56■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.55■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.53■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 APAF1O14727 1248 aa21.53■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTFR1LQ9H019 292 aa21.53■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.53■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GNPATO15228 680 aa21.52■■□□□ 1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DSG3P32926 999 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms