RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484846.1

EHD1-209, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-209ENST00000484846 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.14■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 RABEP1Q15276 862 aa16.14■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.13■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.13■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.13■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 DCTPP1Q9H773 170 aa16.13■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 CLCN1P35523 988 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 ATP7BP35670 1465 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 ABCC4O15439 1325 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 PLCB2Q00722 1185 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 CEP85Q6P2H3 762 aa16.12■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 PIP4K2BP78356 416 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 STK31Q9BXU1 1019 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 USP26Q9BXU7 913 aa16.11■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 HMMRO75330 724 aa16.1■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 REC8O95072 547 aa16.1■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 SLAIN2Q9P270 581 aa16.1■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.1■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 SYCE3A1L190 88 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 NUCB2P80303 420 aa16.09■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.08■□□□□ 0.17
EHD1-209ENST00000484846 ZNF853P0CG23 659 aa16.08■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 ERC2O15083 957 aa16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 DDIT3P35638 169 aa16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 USP6P35125 1406 aa16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.07■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 ADGRB2O60241 1585 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.06■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.05■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 PDE1AP54750 535 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 ANXA1P04083 346 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.04■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 RBSNQ9H1K0 784 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 GNAI2P04899 355 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 PTMSP20962 102 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.03■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.02■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 PALD1Q9ULE6 856 aa16.02■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
EHD1-209ENST00000484846 CHL1O00533 1208 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 MCCP23508 829 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 TMX3Q96JJ7 454 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.02■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 RTL1A6NKG5 1358 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 EYA1Q99502 592 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 BRINP3Q76B58 766 aa16■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 MX1P20591 662 aa16■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 UBAP1LF5GYI3 381 aa16■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 GPT2Q8TD30 523 aa16■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 FLIIQ13045 1269 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 GCP02774 474 aa15.99■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.98■□□□□ 0.15
EHD1-209ENST00000484846 USP32Q8NFA0 1604 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms