RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C4BP0C0L5 1744 aa28.89■■■□□ 2.22
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.89■■■□□ 2.22
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.89■■■□□ 2.21
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.87■■■□□ 2.21
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATP6V1AP38606 617 aa28.87■■■□□ 2.21
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.86■■■□□ 2.21
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MAP3K5Q99683 1374 aa28.86■■■□□ 2.21
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.85■■■□□ 2.21
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.76■■■□□ 2.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.74■■■□□ 2.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GNPATO15228 680 aa28.74■■■□□ 2.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PHF14O94880 888 aa28.73■■■□□ 2.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.59■■■□□ 2.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KLHL34Q8N239 644 aa28.58■■■□□ 2.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.57■■■□□ 2.16
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.57■■■□□ 2.16
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STARD3NLO95772 234 aa28.55■■■□□ 2.16
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KCNQ3O43525 872 aa28.51■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.51■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RIPK4P57078 832 aa28.5■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.5■■■□□ 2.15
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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