RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 SIK1P57059 783 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 IL17REQ8NFR9 667 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 CASZ1Q86V15 1759 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 ITPK1Q13572 414 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 C5P01031 1676 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 ATP6V1AP38606 617 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 SLC39A6Q13433 755 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 NEFMP07197 916 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 LRP5O75197 1615 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 C4BP0C0L5 1744 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 ANP32CO43423 234 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 TEFQ10587 303 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 CCDC184Q52MB2 194 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 MCM10Q7L590 875 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 DCTN1Q14203 1278 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 NFE2L2Q16236 605 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB7AO95365 584 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-206ENST00000443528 SPON1Q9HCB6 807 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 SMIM5Q71RC9 77 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 AK7Q96M32 723 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 ZNF790Q6PG37 636 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 RUNDC1Q96C34 613 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 MTFR1LQ9H019 292 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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ACTB-206ENST00000443528 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 TJP1Q07157 1748 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.78■□□□□ 0.92
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ACTB-206ENST00000443528 KCNQ3O43525 872 aa20.77■□□□□ 0.92
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ACTB-206ENST00000443528 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTB-206ENST00000443528 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.77■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 RIPK4P57078 832 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
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ACTB-206ENST00000443528 PHF14O94880 888 aa20.75■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 SSFA2P28290 1259 aa20.75■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.75■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 RPS6KA4O75676 772 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 MRS2Q9HD23 443 aa20.73■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 NEUROD2Q15784 382 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.72■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
ACTB-206ENST00000443528 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.7■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 APAF1O14727 1248 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 ADRA2BP18089 450 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 MSL1Q68DK7 614 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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