RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439811.1

KRT18P65-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 65, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P65, Length 1,286 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P65-201ENST00000439811 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
KRT18P65-201ENST00000439811 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.46■■□□□ 1.35
KRT18P65-201ENST00000439811 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.46■■□□□ 1.35
KRT18P65-201ENST00000439811 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.46■■□□□ 1.35
KRT18P65-201ENST00000439811 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.46■■□□□ 1.35
KRT18P65-201ENST00000439811 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.45■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 BTBD11A6QL63 1104 aa23.43■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.43■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 MBIPQ9NS73 344 aa23.42■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 ITGB4P16144 1822 aa23.42■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.41■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.4■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 PIGBQ92521 554 aa23.4■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.4■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 NHSQ6T4R5 1651 aa23.4■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.4■■□□□ 1.34
KRT18P65-201ENST00000439811 FAM182BQ5T319 152 aa23.39■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 ZNF790Q6PG37 636 aa23.38■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.38■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.38■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 SBF2Q86WG5 1849 aa23.37■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.37■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 PAPPAQ13219 1627 aa23.37■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 KCNQ2O43526 872 aa23.35■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 ATG3Q9NT62 314 aa23.34■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 SLC39A6Q13433 755 aa23.33■■□□□ 1.33
KRT18P65-201ENST00000439811 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.32■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.32■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 KCNQ3O43525 872 aa23.31■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.31■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.3■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 HOXB7P09629 217 aa23.3■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 BTAF1O14981 1849 aa23.3■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.29■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 TRIM37O94972 964 aa23.29■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.29■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.28■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.28■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 ZNF428Q96B54 188 aa23.28■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 PALLDQ8WX93 1383 aa23.27■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
KRT18P65-201ENST00000439811 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.26■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 VAMP4O75379 141 aa23.24■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 KRT24Q2M2I5 525 aa23.24■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 TSPYL6Q8N831 410 aa23.24■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.23■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.22■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 SIK1P57059 783 aa23.22■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
KRT18P65-201ENST00000439811 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 EP400Q96L91 3159 aa23.2■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 LY75O60449 1722 aa23.19■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 PLSCR1O15162 318 aa23.19■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.19■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.19■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.19■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.19■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 STARD3NLO95772 234 aa23.18■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 APBA3O96018 575 aa23.18■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.18■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 CCDC125Q86Z20 511 aa23.18■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 C5P01031 1676 aa23.18■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 ATP6V1AP38606 617 aa23.17■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.17■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.17■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.17■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 ERBB4Q15303 1308 aa23.16■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.16■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.15■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 STK31Q9BXU1 1019 aa23.15■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 USP16Q9Y5T5 823 aa23.15■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 TJP1Q07157 1748 aa23.15■■□□□ 1.3
KRT18P65-201ENST00000439811 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.13■■□□□ 1.29
KRT18P65-201ENST00000439811 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms