RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CBFA2T2O43439 604 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K11Q16584 847 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TMCO3Q6UWJ1 677 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 SSFA2P28290 1259 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 MYL6BP14649 208 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 DDX11Q96FC9 970 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ERLIN2O94905 339 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 DACH1Q9UI36 760 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 PTPN14Q15678 1187 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM57Q8N5G2 664 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 WDR63Q8IWG1 891 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 PDCL3Q9H2J4 239 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CFAP100Q494V2 611 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 USP25Q9UHP3 1055 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD62A6NC57 917 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TTC39AQ5SRH9 613 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CCT4P50991 539 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CFAP45Q9UL16 551 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 TAF3Q5VWG9 929 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 BTBD11A6QL63 1104 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 TOM1O60784 492 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SYCP1Q15431 976 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC83Q8IWF9 413 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 USP8P40818 1118 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 AACSQ86V21 672 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ZMYND15Q9H091 742 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 MSH6P52701 1360 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SLFN5Q08AF3 891 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 NUTM1Q86Y26 1132 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM22Q8IYM9 498 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 URI1O94763 535 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 TMX1Q9H3N1 280 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SRGAP3O43295 1099 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CHRNA2Q15822 529 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 STIM1Q13586 685 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 WDR97A6NE52 1622 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 TNNT1P13805 278 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ZMYM3Q14202 1370 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC69A6NI79 296 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 SMTNL1A8MU46 457 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 KIF18AQ8NI77 898 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 ACEP12821 1306 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 FCHSD2O94868 740 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA1328Q86T90 577 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRKQ15262 1439 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.1 ms