RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420159.6

ETV1-208, Transcript of ETS variant 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ETV1, Length 6,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1-208ENST00000420159 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 ME1P48163 572 aa6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 SERPINC1P01008 464 aa6.66□□□□□ -1.34
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ETV1-208ENST00000420159 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.66□□□□□ -1.34
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ETV1-208ENST00000420159 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.66□□□□□ -1.34
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ETV1-208ENST00000420159 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.66□□□□□ -1.34
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ETV1-208ENST00000420159 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.65□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 PIK3R4Q99570 1358 aa6.65□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.65□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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ETV1-208ENST00000420159 KIAA0556O60303 1618 aa6.65□□□□□ -1.34
ETV1-208ENST00000420159 PZPP20742 1482 aa6.65□□□□□ -1.34
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ETV1-208ENST00000420159 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.64□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.64□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.64□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.64□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 CAGE1Q8TC20 777 aa6.64□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.64□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 STX6O43752 255 aa6.64□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.64□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.63□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 KIAA0754O94854 1291 aa6.63□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 VPS37DQ86XT2 251 aa6.63□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.63□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.63□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 H0YHG0 523 aa6.63□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 IGHDP01880 384 aa6.63□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 CD109Q6YHK3 1445 aa6.63□□□□□ -1.35
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ETV1-208ENST00000420159 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ZNF445P59923 1031 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ABCC2Q92887 1545 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 EVA1CP58658 441 aa6.62□□□□□ -1.35
ETV1-208ENST00000420159 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.62□□□□□ -1.35
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