RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 LY75O60449 1722 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PAPPAQ13219 1627 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 ITPK1Q13572 414 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 IL17REQ8NFR9 667 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 MTFR1LQ9H019 292 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K5Q99683 1374 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP4-204ENST00000416021 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.07■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 AK7Q96M32 723 aa28.07■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 MSH5O43196 834 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NEFMP07197 916 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGER2P43116 358 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC39A6Q13433 755 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP5O75197 1615 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 TEFQ10587 303 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 CASZ1Q86V15 1759 aa28.01■■■□□ 2.08
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM5Q71RC9 77 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 GNPATO15228 680 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF14O94880 888 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 MCM10Q7L590 875 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 SSFA2P28290 1259 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 DCTN1Q14203 1278 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 MRC1P22897 1456 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.95■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 C5P01031 1676 aa27.95■■■□□ 2.07
SH3BP4-204ENST00000416021 NFE2L2Q16236 605 aa27.95■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 BTBD11A6QL63 1104 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF790Q6PG37 636 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 C4BP0C0L5 1744 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 POLD1P28340 1107 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 ARXQ96QS3 562 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6KA4O75676 772 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 MSL1Q68DK7 614 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNQ3O43525 872 aa27.89■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SH3BP4-204ENST00000416021 ANP32CO43423 234 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 RIPK4P57078 832 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 ADRA2BP18089 450 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 RUNDC1Q96C34 613 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 STARD3NLO95772 234 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 RFC4P35249 363 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT17Q9BSW7 474 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC184Q52MB2 194 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP4-204ENST00000416021 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 NEUROD2Q15784 382 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL34Q8N239 644 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SH3BP4-204ENST00000416021 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.77■■■□□ 2.04
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