RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362065.8

FAN1-201, Transcript of FANCD2 and FANCI associated nuclease 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAN1, Length 4,891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1-201ENST00000362065 ATP2B1P20020 1258 aa14.59□□□□□ -0.07
FAN1-201ENST00000362065 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.59□□□□□ -0.07
FAN1-201ENST00000362065 STK3Q13188 491 aa14.58□□□□□ -0.07
FAN1-201ENST00000362065 TRIM5Q9C035 493 aa14.58□□□□□ -0.07
FAN1-201ENST00000362065 TTC22Q5TAA0 569 aa14.58□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 GPS2Q13227 327 aa14.58□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 STK38Q15208 465 aa14.58□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 F6X3S4 739 aa14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 STARD3NLO95772 234 aa14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ZMYM3Q14202 1370 aa14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 KDM6BO15054 1643 aa14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 SSFA2P28290 1259 aa14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ACEP12821 1306 aa14.56□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 MBD5Q9P267 1494 aa14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 RLBP1P12271 317 aa14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 JMYQ8N9B5 988 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 TNMDQ9H2S6 317 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CFAP45Q9UL16 551 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CCP110O43303 1012 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 FLIIQ13045 1269 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ATP7AQ04656 1500 aa14.54□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CEP170Q5SW79 1584 aa14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 TNRQ92752 1358 aa14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 MCM5P33992 734 aa14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.53□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.52□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 MYD88Q99836 296 aa14.52□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.52□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
FAN1-201ENST00000362065 ABCA8O94911 1581 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 PIK3R4Q99570 1358 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 SYCE3A1L190 88 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 FAM83GA6ND36 823 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 ANAPC15P60006 121 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 CCDC69A6NI79 296 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 HYPKQ9NX55 129 aa14.52□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 KLHL34Q8N239 644 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 FBLN1P23142 703 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 ME1P48163 572 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 POLKQ9UBT6 870 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 A0A1W2PP64 1363 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 PDILTQ8N807 584 aa14.51□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 TXLNAP40222 546 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 TEX35Q5T0J7 233 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 MNS1Q8NEH6 495 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 SPATA32Q96LK8 384 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 VAMP4O75379 141 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 PTPRTO14522 1441 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 METTL24Q5JXM2 366 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.5□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 MAP3K11Q16584 847 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 DCTPP1Q9H773 170 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 CDKL5O76039 1030 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 SMC2O95347 1197 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 TDO2P48775 406 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 ABCC1P33527 1531 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.49□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
FAN1-201ENST00000362065 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms